Ved et økosystem forstår vi oftest et afgrænset geografisk område, hvor dyr, planter og andre organismer, dvs. svampe og mikroorganismer, i samarbejde skaber deres egen biologiske boble. I forbindelse med økosystemer, taler man ofte om nøglearter, dvs. arter, hvis tilstedeværelse/fravær har afgørende betydning for systemet. Et eksempel kunne være et stykke skov, og et eksempel på en nøgleart i en skov, kunne være den genintroducerede bæver, der har central betydning for, hvordan skoven fremtræder og udvikler sig.

Mange er imidlertid ikke klar over, at der under jorden findes et ’usynligt’ økosystem, der er lige så vigtigt, som det over jorden, og som er mere artsrigt og komplekst end systemet over jorden. De to systemer er gensidigt fuldstændigt afhængige af hinanden. I systemet under jorden spiller bakterier, svampe, bittesmå leddyr og forskellige ’orme’ hovedrollerne, og visse typer af regnorme er nøglearter.